أ- مجلس إدارة الاتحاد:
1- (مدير عام مصلحة الجمارك “بصفته” ) رئيسا فخريا لمجلس الإدارة .
2- نائب الرئيس ” أمين عام الاتحاد ” .
3- عضو المجلس للشؤون الإدارية ” مقرر الاتحاد ” .
4- عضو المجلس للشئون المالية ” أمين الصندوق ” .
5- عضو المجلس للعلاقات العامة .
6- عضو المجلس للألعاب الجماعية .
7- عضو المجلس للألعاب الفردية .
8- عضو المجلس لشئون الاستثمار.
9- عضو المجلس للشئون الثقافية .
10- عضو المجلس للشئون الاجتماعية ورياضة المرأة .
ب- الأمانة العامة للاتحاد:
تتكون الأمانة العامة للاتحاد من :ـ
1- أمين عام الاتحاد .
2- مقرر الاتحاد .
3- الأقسام والوحدات الإدارية .
ج – فروع الاتحـــــــــــــاد:
1- اتحاد الجمارك الرياضي فرع بنغازي.
2- اتحاد الجمارك الرياضي فرع طبرق.
3- اتحاد الجمارك الرياضي فرع مصراته.
4- اتحاد الجمارك الرياضي فرع زواره.
5- اتحاد الجمارك الرياضي فرع سبها.
6- اتحاد الجمارك الرياضي فرع الكفرة.
7- اتحاد الجمارك الرياضي فرع غات.